Saat ini ia bermain untuk Afyonspor, mengenakan kaus bernomor 97. Ia bermain terutama sebagai Penyerang. Kaki yang diutamakan adalah Kiri.

Perpindahan terakhirnya adalah dari 1923 Afyonkarahisar SK ke Kurtalan Spor pada 2026-02-19.

Pada musim Liga Kedua Turki 2024-2025, Mustafa Efe Çetinkaya mencetak 0 gol dan memberikan 0 assist dalam 7 penampilan, dengan rata-rata 0 gol per pertandingan dari 0 percobaan tembakan dan 0 tepat sasaran.