Ia bermain terutama sebagai Bek.

Sepanjang Piala Dunia U17 2025, Jovan Nsereko Mukisa tampil dalam 3 pertandingan, dengan rata-rata 0.3 tekel, 0 intersepsi, dan 8 sapuan per pertandingan, serta memblokir 0.3 tembakan per pertandingan.