Jonathan Núñez adalah pemain sepak bola profesional berusia 24 tahun dari HON. Saat ini ia bermain untuk Serigala UPNFM, mengenakan kaus bernomor 8. Di tingkat internasional, ia mewakili Honduras U23. Ia bermain terutama sebagai Gelandang. Nilai pasar saat ini diperkirakan sebesar 250K .

Perpindahan terakhirnya adalah dari CD Motagua ke Lobos UPNFM pada 2026-07-01.

Dalam 2 penampilan di Divisi Pertama Honduras 2025-2026, Jonathan Núñez mencatatkan 0 gol dan 0 assist, sambil menyelesaikan 0 umpan kunci dari total 0 umpan dengan akurasi passing -.